NGS的國產磁珠到底怎么樣?且看國產品牌磁珠表現
目前二代測序中磁珠原料90%以上的產品種類依賴進口,海貍作為早期國產品牌磁珠廠家,將進一步加大第三代化學發光及免疫捕獲磁珠的規模化量產,定位全球市場,致力打造納米磁珠材料領軍品牌。
NGS的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。相比于一代測序,NGS更加省時低成本,速度快,覆蓋度深,準確度高。對于疾病引起的基因突變,NGS可以為患者醫師提供更為準確的診斷依據。目前,二代測序也是現階段科研市場的主力平臺,主要應用包括DNA測序、RNA測序和表觀基因研究等方面。
近年來,高通量測序技術已經日漸成為基因組學研究項目的標準。從樣品制備到文庫制備及最終測序,大多步驟都要求精確高效化、易于自動化操作。磁珠,作為一種新型磁性納米材料,在高通量樣本處理中的應用越來越廣泛。納米磁珠適用于自動化和高通量樣本處理,例如高效提取游離血球外核酸,標記捕獲超微量及痕量生物大分子,已經廣泛應用于唐氏篩查、腫瘤分子和免疫檢測、細胞免疫治療等領域,當前90%以上的產品種類依賴進口,被稱為生物醫學領域的‘芯片級’原料。
海貍作為國內較早期從事納米磁珠技術和產品開發的國家級高新技術企業,近10年來,專注于納米磁珠技術自主研發,從第一代彌散結構納米磁珠技術,第二代核殼結構二氧化硅磁珠,到第三代多夾層結構聚合物磁珠,不斷取得技術突破,持續進行產業升級。
二代測序工作流程:

在NGS整個流程中,有兩款磁珠是必不可少,包括片段篩選和探針捕獲磁珠

表1. 磁珠在二代測序中的應用
行業現狀
片段篩選磁珠
片段篩選磁珠最早是由beckman通過SPRI磁珠技術開發,近幾年國內外稍微有了些品牌,比如Clean NA,Omeaga等。但是國產很少有品牌能夠跟Beckman AMpure XP 1:1替換。海貍技術團隊,采用納米材料和生物技術雙輪驅動,經過3年多的技術開發和反復驗證,推出了DNA片段篩選磁珠,其具備:高純度,精準篩分,良好操作性能特點。在DNA建庫應用測試中,BeaverBeads? DNA Select Isolation的片段回收范圍與進口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可實現進口產品1:1替代。
有圖有真相,且看DNA建庫應用測試

結論:從DNA文庫中篩選300-500bp和500-700bp范圍的片段,BeaverBeads? DNA Select Isolation的片段回收范圍與進口品牌相同,片段回收效率偏差<3%,可實現進口產品1:1替代。
探針捕獲磁珠
探針捕獲磁珠,基本上使用鏈霉親和素磁珠,目前幾乎使用進口磁珠,如Dynabeads M270。國內幾乎無替代。海貍深耕納米磁珠技術10多年,經過三代技術革新,推出了多層結構的鏈霉親和素磁珠。其具備:低背景,高載量,粒徑均一特點。

BeaverBeads streptavidin掃描電鏡成像
有圖有真相,且看核酸探針捕獲對比測試

測試結果顯示:核酸探針結合量與進口磁珠相當,目的核酸探針捕獲效率達到進口磁珠的90%。
當前二代測序中磁珠原料90%以上的產品種類依賴進口,海貍作為早期國產品牌磁珠廠家,將進一步加大第三代化學發光及免疫捕獲磁珠的規模化量產,定位全球市場,致力打造納米磁珠材料領軍品牌。
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